Leonardo, Donatello, Raphael y Michelangelo vuelven a la carga. En lo profundo de las alcantarillas de la ciudad de Nueva York, estos cuatro hermanos adolescentes emprenden nuevas aventuras aprovechando sus poderes místicos de tortugas ninja mutantes. Mientras aprenden a trabajar juntos como un equipo, se enfrentarán a grandes peligros y reinos ocultos, para cumplir su cometido de convertirse en un equipo de héroes. Esta película de animación está basada en la serie animada Rise of the Teenage Mutant Ninja Turtles.